|
Description
|
Conjunto de datos sobre el estudio de la arquitectura genómica, la diversidad de plásmidos y los mecanismos de conjugación de Sinorhizobium meliloti LPU88, una bacteria fijadora de nitrógeno simbionte de la alfalfa. Incluye las secuencias genómicas completas (cromosoma y plásmidos pSmeLPU88a, b, c, d), el análisis de pangenoma de 30 cepas de S. meliloti (matrices de genes core, shell y cloud), la identificación de profagos (mediante PHASTER y Phigaro) y el inventario de Secuencias de Inserción (IS) detectadas con ISEscan. Además, se proporcionan datos detallados sobre módulos de conjugación y replicación (tra, mob, vir, trb, repABC, rct, parS) y los resultados de validación experimental (RT‑PCR de genes de conjugación).
Dataset on the study of the genomic architecture, plasmid diversity, and conjugation mechanisms of Sinorhizobium meliloti LPU88, a nitrogen‑fixing bacterium symbiotic with alfalfa. It includes the complete genome sequences (chromosome and plasmids pSmeLPU88a, b, c, d), the pangenome analysis of 30 S. meliloti strains (core, shell, and cloud gene matrices), the identification of prophages (using PHASTER and Phigaro), and the inventory of Insertion Sequences (IS) detected with ISEscan. In addition, detailed data on conjugation and replication modules (tra, mob, vir, trb, repABC, rct, parS) and experimental validation results (RT‑PCR of conjugation genes) are provided.
|
|
Keyword
|
Sinorhizobium meliloti, conjugación de plásmidos, secuencias de inserción, profago, pangenoma, minería de genomas, plasmid conjugation, insertion sequences, prophage, pangenome, genome mining |
|
Related Publication
| Rey, C., Toscani, A. M., Nilsson, J. F., Castellani, L. G., Rocco Welsh, R. E., Luchetti, A., Busche, T., Kalinowski, J., Tejerizo, G. T., & Pistorio, M. (2026). Comparative genomic analysis of Sinorhizobium meliloti LPU88: Plasmid diversity and conjugative mechanisms. [Manuscript submitted for publication].
|
